Didžiosios Britanijos šikšnosparniai atskleidė anksčiau nežinomą sarbecovirusą

Didžiosios Britanijos šikšnosparniai atskleidė anksčiau nežinomą sarbecovirusą
Didžiosios Britanijos šikšnosparniai atskleidė anksčiau nežinomą sarbecovirusą
Anonim

Mokslininkai atrado naują sarbecovirusą RhGB01, ištyrę tik 53 pasagos šikšnosparnių išmatų mėginius, išplėsdami koronavirusų, tokių kaip SARS-CoV ir SARS-CoV-2, geografines ir rūšių ribas. Manoma, kad jų galima rasti visoje Rhinolophidae veislėje - nuo Australijos ir Japonijos iki Europos ir Afrikos.

Praėjus daugiau nei metams, dabartinio koronaviruso protrūkio šaltinis vis dar nežinomas, nepaisant tūkstančių tyrimų, PSO ataskaitų, tyrimų ir dar daugiau. Pasagos šikšnosparniai (Rhinolophus) yra laikomi natūraliais šeimininkais tiek SARS-CoV (sunkus ūminis kvėpavimo sindromas, kuris atsirado 2002 m.), Tiek mūsų SARS-CoV-2, tačiau nenustatytas tarpinis nešėjas, pernešęs virusą žmonėms.

Šikšnosparnių asortimentas apima didžiąją Senojo pasaulio dalį, tačiau didžioji dalis mėginių buvo paimti Rytų ir Pietryčių Azijoje: ten buvo rasta apie 50 su SARS susijusių koronavirusų dešimtyje šikšnosparnių rūšių, iš kurių 48 priklauso devynioms skirtingoms šikšnosparnių rūšims. pasagos šikšnosparniai. Kinijoje pasagos formos naujų sarbecovirusų, ty koronavirusų, susijusių su SARS, filogenetinė analizė parodė, kad jie yra labiausiai susiję su SARS-CoV ir SARS-CoV-2.

Rytų Anglijos universiteto mokslininkai nusprendė papildyti šiuos duomenis. Tyrimo, paskelbto vakar žurnale „Scientific Reports“, autoriai 2020 metų rugpjūčio ir rugsėjo mėnesiais surinko išmatas iš dešimčių mažų pasagos formos gyvūnų Somersete, Monmutšyre ir Velse. Gyvūnai buvo sugauti naudojant spąstus ar tinklus, esančius netoli prieglaudų ir miškuose.

Išmatos buvo dedamos į atskirus sterilius mėgintuvėlius, kuriuose yra RNR laterio tirpalas RNR stabilizavimui, prieš analizę atšaldomas ir laikomas užšaldytas. Tada mokslininkai atliko genomo seką, kuri viename iš 53 mėginių nustatė anksčiau nežinomą virusą. Jis buvo pavadintas RhGB01. Virusą sudaro 10 koduojančių genų, o SARS-CoV ir SARS-CoV-2-11 genų, kuriuose yra ORF8 baltymo.

„Smeigtuko baltymų ir nukleotidų sekų filogenezė parodė, kad RhGB01 yra sujungtas monofiletiškame klade su BM48-31 / BGR / 2008,„ Blasius “pasagos šikšnosparnio virusu (Rhinolophus blasii), atrastu 2008 metais Bulgarijoje. RhGB01 skiriasi nuo kladų, kuriuose yra patogeninių žmogaus beta-koronavirusų SARS-CoV ir SARS-CoV-2, tačiau glaudžiau koreliuoja su koronavirusu, susijusiu su sunkiu ūminiu kvėpavimo sindromu “,-rašo mokslininkai.

Pagrindinis receptorius SARS-CoV ir SARS-CoV-2 prasiskverbimui į organizmą išlieka ACE2 fermentas, šią galimybę jam suteikia receptorių surišimo motyvas (RBM), esantis receptorių surišimo srityje (RBD). S -baltymas - jis sudaro viruso apvalkalą. Naujasis RhGB01 turi 68% ir 67% aminorūgščių tapatybę atitinkamai su RBD SARS-CoV ir SARS-CoV-2, tačiau tik 43% ir 48% panašūs į juos RBM. Palyginimui: artimiausi virusai, susiję su SARS-CoV-2, šikšnosparniai ir pangolinai, 89% ir 86% sutampa su RBD SARS-CoV-2 ir 75, 77%-su SARS-CoV. Be to, RhGB01 rodo mažą ŽSM panašumą į Artimųjų Rytų kvėpavimo sindromo virusą (MERS). Tačiau jis neturi papildomos furino skilimo vietos S1 ir S2 baltymų sankirtoje, kuri būdinga SARS-CoV-2.

„Žemas panašumo lygis, kontaktinių likučių trūkumas ir struktūriniai skirtumai, palyginti su SARS-CoV ir SARS-CoV-2 receptorių surišimo sritimi, greičiausiai rodo gebėjimo prisijungti prie ACE2 trūkumą. Todėl mažai tikėtina, kad RhGB01 bus zoonozinis, jei nebus mutavęs. Tačiau norint atlikti eksperimentinį patvirtinimą, kad nėra prisijungimo prie ACE2 ar kitų žmogaus ląstelių receptorių ir nustatomas gebėjimas prisijungti prie kitų žinduolių ACE2 receptorių, reikia atlikti in vitro tyrimus “, - pažymėjo tyrimo autoriai.

Nors atrodo, kad RhGB01 egzistuoja tūkstančius metų, mokslininkai mano, kad verta sustiprinti koronavirusų stebėjimą pasagų šikšnosparniuose visame jų paplitimo diapazone, taip pat kitų rūšių šikšnosparnius. Galų gale, SARS-CoV ir SARS-CoV-2, tikėtina, išsivystė dėl mutacijos, homologinės rekombinacijos (nukleotidų sekų keitimasis tarp dviejų panašių ar identiškų chromosomų) ir „praeinant“bent per vieną tarpinį šeimininką.

Tai yra, natūralaus šeimininko viruso pirmtakas gavo genetinę adaptaciją, kuri leido sėkmingai užkrėsti žmones ir perduoti tarp mūsų. Ir kai yra galimybė homologiškai rekombinuotis sarbecovirusus per bendrą infekciją, yra naujų zoonozių pavojus.

„Bet koks šikšnosparnis, nešantis į SARS panašų virusą, gali tapti mutacijų katilu. Ir jei šikšnosparniai su RhGB01 užsikrės SARS-CoV-2, yra pavojus, kad šie virusai hibridizuosis-ir atsiras naujas, kuris jau galės užkrėsti žmones “,-padarė išvadą tyrėjai.

Rekomenduojamas: