Svetimas ir baisesnis. Ar įmanoma atpažinti pavojingą koronaviruso variantą, kol jis neužkariauja pasaulio

Turinys:

Svetimas ir baisesnis. Ar įmanoma atpažinti pavojingą koronaviruso variantą, kol jis neužkariauja pasaulio
Svetimas ir baisesnis. Ar įmanoma atpažinti pavojingą koronaviruso variantą, kol jis neužkariauja pasaulio
Anonim

Graikų abėcėlėje yra 24 raidės. Šiek tiek mažiau nei pusė buvo išleista koronaviruso variantų pavadinimams, tačiau jau dabar aišku, kad tai ne riba. Vargu ar pavyks sustabdyti SARS-CoV-2 evoliuciją, ir, ko gero, vieną dieną bus naudojamos kitos abėcėlės. Mums belieka prie to prisitaikyti - ir išmokti nuspėti, koks pavojingas pasirodys tas ar kitas atvykėlis. Mes jums pasakysime, kaip galima sukurti tokią prognozę ir į ką turėtumėte atkreipti dėmesį, kad laiku imtumėtės priemonių - arba, priešingai, dar kartą nepanikuokite, kai išgirsite apie kitą priepuolį ar sigmą horizonte.

Deltos koronavirusas buvo paskelbtas susirūpinimo variantu 2021 m. Tada jis dar nebuvo vadinamas „delta“, o PSO ekspertai ginčijosi, ar jis tikrai labiau užkrečiamas nei jo pirmtakai. Tačiau trečioji pandemijos banga, kurią, kaip dabar suprantame, daugiausia sukėlė delta, tuo metu tęsėsi beveik tris mėnesius.

Delta laiko juosta

  • 2020 m. Lapkričio 11 d. - naujojo varianto genomas pirmą kartą pasirodo GISAID duomenų bazėje
  • 2021 m. Vasario 5 d. - epidemiologai tą patį variantą pastebi antrą kartą
  • 2021 m. Kovo 10 d. - Indijoje prasidėjo „Covid“protrūkis
  • 2021 m. Kovo 24 d. - Indijos vyriausybė praneša apie naują šalyje aptiktą koronaviruso variantą
  • 2021 m. Kovo 30 d. - naujos versijos seka rodoma „github“. Pranešama, kad jis plinta grupėmis ir jau pasiekė Europą, JAV, Australiją ir Kanadą, o Indijoje yra atsakingas už maždaug 20 proc.
  • 2021 m. Balandis - „delta“pirmą kartą pasirodo Rusijos konsorciumo „Corgi“bazėje
  • 2021 m. Gegužės 10 d. - PSO pripažino „Delta“kaip susirūpinimą keliančią galimybę
  • 2021 m. Gegužės 20 d. - „Rospotrebnadzor“vadovas paskelbė apie „delta“pasirinkimo atsiradimą Rusijoje

Dabar beprasmiška ginčytis, ar būtų galima išvengti naujos pandemijos bangos - pasaulyje, ar bent jau Indijoje ar Rusijoje atskirai. Tačiau būtų gerai pagalvoti, kaip pasiruošti kitam variantui, kad jį vis dar pakeliui pagautumėte ir, jei įmanoma, išvengtumėte aukų.

Koronaviruso abėcėlė 2021 m. Rugpjūčio mėn

Susirūpinimą keliantys variantai:

ɑ (B.1.1.7)- atrasta JK 2020 metų rugsėjį

β (B.1.351)- atrastas Pietų Afrikoje 2020 m

ɣ (1 psl.)- atrasta Brazilijoje 2020 m

Δ (B.1.617.2)- atrasta Indijoje 2020 m. gruodžio mėn

Dominantys variantai:

η (B.1.525) - atrastas Nigerijoje 2020 m. gruodžio mėn

κ (B.1.617.1) - atrasta Indijoje 2020 m

ƛ (C.37) - atrasta Peru 2020 m. gruodžio mėn

ι (B.1.526) - atrastas JAV 2020 m. gruodžio mėn

Parinktys, kurios lieka stebimos (tolesniam stebėjimui):

ε (B.1.427 / B.1.429) - atrastas JAV 2020 metų rugsėjį

ζ (2 psl.) - atrastas Brazilijoje 2021 metų sausį

θ (3 psl.)- atrastas Filipinuose 2021 metų sausį

Austrijos mokslo ir technologijų instituto evoliucijos biologas Fiodoras Kondrašovas mano, kad sekos nustatymas čia galėtų padėti.

„Norint suprasti, kuris variantas yra pavojingas, o kuris nėra pavojingas, - pataria jis, - labai naudinga gauti kuo daugiau duomenų. Dabar mes sakome, kaip tai blogai - 10 procentų gyventojų turėjo kokį nors variantą, bet 50 procentų. Tačiau įsivaizduokite, kad pamatytume, jog koks nors variantas atsiranda 0,01 proc. Užsikrėtusiųjų, o dabar - 0,1 proc. Tai visiškai kitokia situacija “.

Tai reiškia, kad kiekviename kiekvienos šalies regione būtina įrengti genetinę laboratoriją - berniuką įdėti į seką, kad būtų galima stebėti visas koronaviruso rūšis, nuo kurių kenčia gyventojai. Ir jis šaukė „vilkai!“Jei pastebėjo įtartiną krūmų judėjimą - kol gyvūnai nepradėjo skubėti į žmones.

Tačiau šis planas neatrodo realus net jo autoriui. Kondrašovas pripažįsta, kad tokiai sistemai reikės tokių piniginių investicijų, kurios vargu ar kada nors atsipirks. Bet įsivaizduokime, kad tai atsitiko, bent jau vienoje šalyje. Kiekviename savo mieste valdžios institucijos įrengė seką, kuri be pertraukos per pietus ir miegą skaito viruso genomus. Belieka tik suprasti: koks judėjimas įtartinas? Dėl kokių naujo varianto savybių turėtume susirūpinti prieš prasidedant protrūkiui?

Kur yra mutacija?

SARS-CoV-2 genome yra beveik 30 tūkstančių nukleotidų. Tačiau dauguma šiandien girdimų mutacijų yra poros šimtų nukleotidų regione - tai yra S -baltymo RBD (receptorių surišimo domenas): vieta, kur virusas prilimpa prie ACE2 molekulės ląstelės paviršiuje.

Image
Image

Koronaviruso SARS-CoV-2 genomas

Žinoma, tai nereiškia, kad likusio jo genomo nemutuoja koronavirusas. Kiekvienas naujas variantas turi dešimtis pokyčių, dauguma jų turi įtakos kitiems S-baltymo regionams ar kitiems genams. Kai kurie iš šių pokyčių gali rimtai paveikti viruso biologiją. Taigi, alfa variante (apie tai kalbėjome tekste „Gavome naują“) buvo rasta mutacija, kuri padidina viruso baltymo orf9 gamybą. Ji yra atsakinga už šeimininko imuniteto slopinimą - tai reiškia, kad tokia mutacija gali leisti virusui ilgiau išgyventi organizme.

Tuo tarpu kitų veislių koronaviruso atveju genetikai pastebėjo orf1ab geno mutaciją, kuri, priešingai, slopino viruso dauginimąsi. Tai trukdė Nsp1 baltymo darbui, kuris neleidžia ląstelės šeimininkės gaminti jokių kitų baltymų, išskyrus virusinius.

Ir vis dėlto virusologus pirmiausia domina smaigalinis baltymas. „Tiesiog išorės stebėtojo požiūriu tai lemia viruso savybes“, - aiškina „Skoltech“evoliucijos biologas Georgijus Bazykinas, „tai yra imuninė sistema ir tos ląstelės, į kurias jis bando prasiskverbti. Tai ir pirmoji viruso atakos linija, ir pirmoji gynybos linija “.

Imuninė sistema „žiūri“į smaigalį, kai ji atrenka antikūnus. Ten, matyt, „atrodo“natūrali atranka: bent jau mutacijos joje dažniau nei kitos sutampa skirtinguose viruso variantuose. Todėl turėsime pažvelgti ir į smaigalį, kad suprastume, ar „seni“antikūnai praras savo efektyvumą prieš naująjį variantą.

Tačiau tai nenuostabu. Lygiai tas pats atsitinka ir su kitais virusais - ar tai būtų ŽIV, ar gripas - virusologai pirmiausia domisi paviršiniais baltymais. Ir tai supaprastina mūsų užduotį: nepaisant to, kad sekventuotojai paprastai skaito visą viruso genomą, iš anksto žinome, kur tikėtis bėdų.

Ji tikra?

Berniukai, kurie šaukia „vilkai!“, Žinoma, klysta. Sekėjai taip pat klysta. „Yra keletas vietų koronaviruso genome, - aiškina Bazykinas, - kuriose kai kurios sekos nustatymo technologijos suklumpa. Jums atrodo, kad yra citozino, nors iš tikrųjų ten yra uracilo “.

Tai reiškia, kad mutacijos, kurias sekvencininkas „pamatė“, iš tikrųjų gali ir nebūti. Bet jei tokią klaidą palyginti lengva atpažinti ir ištaisyti, tada daug sunkiau atskirti paties naujojo varianto mutaciją nuo daugybės mažų pokyčių, kuriuos virusas sukaupė per savo gyvenimą šeimininko viduje.

Žmogaus ląsteles nuo virusų apsaugo APOBEC šeimos baltymai. Jie redaguoja virusinę RNR, atsitiktinai paversdami citozinus į uracilus, tikėdamiesi sulaužyti geną. Ir kadangi kiekvienas koronaviruso mėginys, kurį dedame į seką, yra iš konkretaus paciento, mes niekada tiksliai nežinome, kaip interpretuoti aptiktas mutacijas. Tai gali būti svarbi naujos versijos savybė, būdinga visoms jos kopijoms, arba tai gali būti APOBEC darbo rezultatas. Bet kadangi šie baltymai yra vienodi visiems žmonėms, jie visada atliks panašius pakeitimus. „Labai sunku atskirti funkcinį paralelizmą nuo lygiagretumo, susijusio su redagavimu, - skundžiasi Bazykinas, - ir jei matote, kad jūsų evoliuciniame koronaviruso medyje mutacija įvyko tūkstantį kartų nepriklausomai, tai, deja, nebūtinai reiškia, kad ši mutacija yra naudinga virusui “.

Todėl norint sukurti naujos versijos mutacinį portretą nepakanka tik berniuko, turinčio seką. Jei norime būti tikri, kad jo genų pokyčiai yra tikrai svarbūs ir palaikomi atrankos, turėsime tai įrodyti in vitro: surinkti mutantinį smaigalio baltymą ir patikrinti, ar jis geriau jungiasi prie tikslo, ar blogiau - prie antikūnų.

Image
Image

Taigi, tikėtina, smaigaliniai baltymai atrodo skirtinguose koronaviruso variantuose

Galbūt šią užduotį būtų galima patikėti kompiuteriui - ir apsiriboti pakeisto baltymo modeliu. Tačiau abu pašnekovai N + 1 sutinka, kad kol kas mes galime tai padaryti gana blogai. Berniukas su kompiuteriniu modeliu dar neturi tikėjimo, todėl mes negalime apsieiti be berniuko su mėgintuvėliu.

Ar mes ją pažįstame?

Kai kurių mutacijų modeliuoti nereikia - tos, kurios buvo įtrauktos į ankstesnius koronaviruso variantus ir todėl jau buvo tirtos plačiai. Genetika kai kuriuos iš jų taip uoliai aptarė, kad netgi davė jiems žmonių vardus - kad būtų lengviau ištarti. Taigi pakaitalas D614G (čia D ir G yra pradinių ir galutinių aminorūgščių kodai, o 614 - jų padėtis baltymuose), dėl kurio smaigalys baltymas prilimpa prie ACE2 receptoriaus, buvo pavadintas Doug. Ir E484K, dėl kurio virusas mažiau matomas antikūnams, tapo Eriku.

Kartu su pavadinimu mutacijos mokslo bendruomenėje įgauna vis didesnį dėmesį, o kartu ir potencialiai pavojingos būklės. Štai kodėl, pavyzdžiui, „delta plus“variantas (AY.1), pirmą kartą pastebėtas Indijoje balandžio pabaigoje, sukėlė didelį susirūpinimą - netgi privertė, pavyzdžiui, JK apriboti oro eismą su Portugalija. Be įprastinei deltai būdingų pakeitimų, AY.1 variantas įgijo Karen mutaciją (Karen, K417N). Mes jau ją sutikome Pietų Afrikos beta versijos genome ir žinome, kad šis susitikimas nieko gero nežada: manoma, kad būtent „Karen“leidžia beta pabėgti nuo prisijungimo prie antikūnų.

Mutacijos, pelniusios sau vardą

Doug (Doug, D614G):Galimi visi esami variantai. Padidina prisijungimą prie ACE2.

Erikas (E484K):Galimos beta, gama, eta, teta, iota ir zeta parinktys. Išvengia antikūnų.

Karen (Karen, K417N): Galima įsigyti koronaviruso beta versiją. Sumažina prisijungimą prie ACE2. Išvengia antikūnų.

Kentas (Kentas, K417T): Galima gama versija. Sumažina prisijungimą prie ACE2. Išvengia antikūnų.

Leifas (L18F): Galima naudoti kai kuriose beta versijose. Išvengia antikūnų.

Nelly (Nelly, N501Y): Alfa, beta, skalė, teta turi. Padidina prisijungimą prie ACE2.

Pūkuotukas (P681H): Alfa ir teta variantai. Padidina užkrečiamumą (padeda prasiskverbti į ląstelę, apeinant ACE2).

Šonas (S477N): Rasta kai kurių veislių iš Australijos ir Niujorko. Išvengia antikūnų.

Žinoma, būtų naudinga numatyti mutacijų savybes dar prieš jiems patekus į sekvencinį įrenginį ir gavus pavadinimus. Mes palaipsniui einame šia linkme Jesse Bloom grupės Sietle dėka. Kartu su kolegomis Bloomas, naudodamas prisotinimo mutagenezę, tiria koronaviruso galimybių spektrą: mokslininkai atlieka visus įmanomus pakeitimus kiekvienoje S-baltymo amino rūgštyje ir verčia mielių ląsteles gaminti šiuos mutantinius baltymus. Pasirodo, mielių kultūrų biblioteka, kurių kiekviena ląstelės paviršiuje atskleidžia savo S-baltymo versiją, kuri nuo originalo skiriasi viena aminorūgštimi. Šviesos receptorius ACE2- pridedamas prie kiekvienos kultūros ir skaičiuojamas, kaip dažnai jis nusėda ant mielių ląstelių. Remdamasis eksperimento rezultatais, „Bloom“sukuria raudonai mėlynas lenteles, kuriose raudonesnė ląstelė, tuo stipresnis surišimas - ir potencialiai pavojingesnė mutacija. „Jei kas nors nori nuspėti COVID raidą, - sako Bazykinas, - čia yra geriausi duomenys, kaip tai padaryti“.

Image
Image

Mutantinių smaigalių baltymų su ACE2 surišimo lentelės. Horizontali - padėtis baltymuose, vertikali - aminorūgščių pakeitimo galimybė

Kitur Bloomas ir jo kolegos susiduria su savo modifikuotais baltymais su antikūnais ir daro išvadas apie tai, kurie pakaitalai gali būti labiau slidūs. Pavyzdžiui, iš jo darbų matyti, kad „Karen“(K417N) yra vienas nemaloniausių pakeitimų 417 pozicijoje, tik hipotetinė „Katya“(K417I) gali būti blogesnė, o „Ericas“(E484K) nėra toks. baisus kaip jo galimas brolis „Emilis“(E484L), su kuriuo mes niekada nesame susitikę.

Image
Image

Taip skirtingi aminorūgščių pakaitalai padeda smaigalio baltymui pabėgti nuo antikūnų. Kuo didesnė raidė, tuo stipresnis pabėgimas. Spalva rodo mutanto baltymo prisijungimo stiprumą prie ACE2

Kas dar yra genome?

Problema ta, kad dauguma šių mutacijų toli gražu nėra naujos. Per tą laiką, kai koronavirusas vaikščiojo po pasaulį, jis ląstelėse daugėjo tiek kartų, kad kiekvienas pakeitimas neišvengiamai turėtų atsirasti. Tačiau kodėl tarp daugelio mutacijų tik kelios įsitvirtino, vis dar neaišku. Galbūt faktas yra tas, kad kiekvienas pakeitimas nėra ypač pavojingas po vieną - ir jie „šaudo“tik tada, kai ketina sukurti naują versiją.

Pavyzdžiui, delta smaigalio baltymuose vienu metu pasikeitė dvi amino rūgštys.

  1. E484Q mutacija įtartinai priminė Ericą (E484K), kuri jau buvo žinoma, kad geriau prisijungia prie ACE2 receptorių ir blogiau su antikūnais.
  2. P681R mutacija buvo labai panaši į Pūkuotuką (P681H), kuris yra atsakingas už viruso užkrečiamumą. Dėl 681 aminorūgšties pokyčių S baltymo vieta labiau prilimpa prie žmogaus fermento furino. Virusas susitinka su furinu ląstelių viduje, prieš išeidamas į lauką. Furinas supjausto S baltymą (tai vyksta ląstelių viduje) ir daro jį lipnesnį kitam fermentui, TMPRSS2. Kai virusas ruošiasi užkrėsti kitą ląstelę, jis savo paviršiuje gali susitikti su TMPRSS2, kuris vėl supjausto S baltymą - ir tada baltymas gali tiesiogiai prilipti prie naujos ląstelės membranos, nedalyvaujant ACE2.

Dviejų mutacijų sąjunga pasirodė abipusiai naudinga: pirmoji padėjo antrajai atlaikyti antikūnų antpuolį, o antroji leido pirmajai plačiau paplisti populiacijoje. Tiesa, neaišku, kodėl jiems prireikė tiek laiko įsitvirtinti viename genome. Galbūt faktas yra tas, kad koronaviruso genomai ne itin intensyviai rekombinuojasi ir nesikeičia regionais - tai reiškia, kad virusas turi pasikliauti atsitiktinumu. Tačiau kituose koronavirusuose buvo aprašyta rekombinacija. Tačiau SARS-CoV-2, pasak Bazykino, nėra lengva jį aptikti-skirtingų variantų genomai yra gana panašūs vienas į kitą, ir ne visada įmanoma atskirti rekombinaciją nuo taškinio pakeitimo.

Akivaizdu, kad laikui bėgant koronaviruso variantų pakeitimų skaičius tik augs. 2020 metais Dag mutacija (D614G) išplito taip sėkmingai, kad dabar ji net nėra nurodyta vieno ar kito varianto požymių sąrašuose - ji randama kiekviename iš jų. Tas pats gali atsitikti ir su delta: jos mutacijos gali tapti nauja norma, jei ji yra tvirtai įsitvirtinusi populiacijoje ir pati tampa dirva tolesnei evoliucijai (kas jau vyksta po truputį, kaip matyti iš „ delta plius “variantas).

Image
Image

Įvairių mutacijų vieta beta spike baltyme

Todėl Jesse Bloom lentelės turėtų būti pakeistos daugiamatėmis matricomis - bandymai iš anksto apskaičiuoti, kaip vienu metu keisis vieno baltymo aminorūgščių sąveika. Kompiuteriniam modeliavimui čia nėra vilčių ir juo labiau. Ir tai nėra lengva užduotis prisotinti mutagenezę. „Yra keletas dešimčių baltymų pozicijų, kurios, kaip žinoma, yra svarbios, - vertina Bazykinas, - ir kiekvienoje iš jų gali būti 20 skirtingų aminorūgščių. Norėdami poromis patikrinti visus mutacijų derinius, turėsite padaryti 19x19x190 naujų genotipo variantų - tai yra, apie 70 tūkst. Tai vis tiek per brangu “. Jei sąrašą sumažiname iki penkių pozicijų, reikia tik 3610 matavimų - tai, pasak mokslininko, skamba tikroviškiau. „Tai būtų labai gera užduotis, - sutinka jis, - jei kas nors turėtų pinigų ir galimybių. Ir aš manau, kad tai bus padaryta “.

Kas yra aplink?

Taigi, tarkime, mes išsamiai ištyrėme kito varianto genomą ir ištyrėme, kokią riziką kelia kiekviena jo mutacija. Net jei suprantame, kokias gudrybes jis pasiima rankovėmis, to nepakanka nuspėti, kaip jis elgsis žmonių visuomenėje.

Kadangi ši pandemija pas mus jau seniai, nė viena galimybė nepasirodo tuščioje vietoje - ji iškart konkuruoja su tais, kurie jau „maitinasi“šioje populiacijoje. Ir jie pradeda, kaip sakė Bazykinas, „stumti šonus“. „Atsiranda variantas, - sako jis, - viruso požiūriu labai geras, tačiau jam plisti neleidžia kitas variantas, kuris galbūt nėra toks geras, bet kartu su juo cirkuliuoja“.

Be to, ankstesni variantai, kurie „ganėsi“tiems patiems žmonėms, jau paliko palikimą - įgyto imuniteto pavidalu. O tiems, kurie sirgo ar pasiskiepijo nuo viruso, reikia visiškai kitokio požiūrio. Jei naivioje populiacijoje pakankamai lengva greitai plisti, tai imunizuotoje populiacijoje tie, kurie nematomi antikūnams, gali pradėti - tai leidžia žmonėms vėl užsikrėsti. Todėl gali pasirodyti, kad ta pati mutacija ne visose situacijose laimi. Pvz., Jei jis sumažina prisijungimą prie ACE2 ir tuo pačiu metu yra mažiau „matomas“antikūnams (kaip, matyt, veikia „Karen“), naivioje populiacijoje galima tikėtis, kad jis praras, o imunizuotas gyventojų ji laimės.

Dėl to net pavojingiausių koronaviruso variantų likimas gali pasirodyti netikėtas. Pavyzdžiui, delta pirmą kartą buvo pastebėta dar 2020 m. Lapkričio mėn., O bendras visų deltų protėvis, atrodo, atsirado mėnesiu anksčiau. Tačiau beveik pusę metų šiam variantui nepavyko išsiveržti į priekį.

Beta apsaugo nuo vakcinos imuniteto geriau nei dauguma kitų ir išplito beveik visame pasaulyje. Tačiau visa tai nepadėjo jam aplenkti varžovų. Iš anksto nesirūpindami infekcijos padidėjimu, beta versija beveik visose šalyse dabar yra prastesnė už deltą. Ir net Maskvoje, kur balandį jos dalis netikėtai padidėjo, beta versija dabar yra beveik nereikšminga.

Tas pats likimas ištiko ir B.1.1.523 „Maskvos“versiją (ji negavo graikiško laiško, nes PSO manė, kad ji nėra pakankamai įtartina, kad būtų įtraukta į „susirūpinimą keliančių priežasčių“sąrašą). Balandį ji užkrėtė daugiau žmonių nei alfa ir beta kartu sudėjus, bet taip pat pasidavė spaudžiant deltai.

Image
Image

Įvairių koronaviruso variantų dalis tarp Maskvos mėginių

Kiekvienas variantas yra spaudžiamas iš kelių pusių - tiek koronaviruso kaimynų, tiek žmogaus imuninės sistemos. Todėl prisitaikymo prie šio slėgio vektorius skirtingose populiacijose skirsis. Todėl niekas dar neįsipareigojo nuspėti, kurias mutacijų atrankas palaikys, o kurios atmes, ir ar po kurio laiko ji persigalvos.

Kur eiti?

Nepaisant to, jau galime kažką pasakyti apie žmogaus ateitį ir jo koronavirusą. Turime patirties iš ankstesnių pandemijų.

„Nemanau, kad evoliucija pasiekė maksimumą, kurį šis virusas gali padaryti per tokį trumpą laiką“, - sako Fiodoras Kondrašovas. Bazykinas jam pritaria: „pagal natūralios atrankos apibrėžimą“, - primena jis, - pasirenkami labiausiai perduodami variantai. Todėl galima tikėtis, kad šie įtartini variantai bus labiau užkrečiami nei delta.

Tačiau tai nereiškia, kad pasikeis pats ligos pobūdis. „Virusui, - aiškina Bazykinas, - nerūpi, kokie sunkūs jo simptomai. Jam svarbu, kaip lengvai jis perduodamas iš vieno žmogaus kitam, ir kas atsitiks šiam asmeniui, jam nerūpi “. Todėl mažai tikėtina, kad natūrali atranka specialiai palaikys mutacijas, dėl kurių virusas tampa mirtingesnis. Kitas dalykas - kuo labiau užkrečiamas virusas, tuo daugiau žmonių tuo pačiu serga - tuo didesnė našta tenka sveikatos priežiūros sistemai. Tai reiškia, kad gyventojų mirties rizika gali padidėti - ir ne tik nuo COVID.

Tačiau žmonija nestovi vietoje. Per tą laiką, kai virusas sukaupė porą dešimčių aminorūgščių pakaitalų, sukūrėme kelias dešimtis vakcinų nuo koronaviruso. Kad išvengtų savo veiksmų, virusas turėjo įgyti naujų mutacijų, tačiau skiepijimo kampanija sumažina replikuojančių virusų skaičių populiacijoje ir tampa vis sunkiau vystytis.

„Efektyvus reprodukcinis skaičius, - pažymi Bazykinas, - šalyse, kurios yra iš dalies imunizuotos ir kur dabar plinta delta, yra maždaug toks pat, koks buvo 2020 m. Pradžioje, kai virusas buvo jaunas ir nepatyręs, o mes buvome jauni ir nepatyrę. Per pusantrų metų jis išmoko geriau mūsų išvengti, o mes - jį geriau pagauti. Ir jie bėgo paskui jį pakankamai greitai, kad abu liko toje pačioje vietoje. Tačiau norėdami kažkur patekti iš šios vietos, turėsite bėgti kelis kartus greičiau - tai yra, aprūpinti žmones imunitetu greičiau, nei virusas padidina jo užkrečiamumą.

Ir čia yra laimikis. Kuo stipriau spaudžiame virusą, tuo stipresnė paskata jam vystytis. Kaip neseniai apskaičiavo Fiodoras Kondrašovas ir jo kolegos, tikimybė, kad nuo skiepų atsiras naujų koronaviruso variantų, tuo didesnė, tuo mažiau gyventojų nesulauks imuniteto. Ir ši tikimybė pasiekia piką maždaug tuo metu, kai populiacija artėja prie bandos imuniteto. Ir jei pradinei, Uhano versijai, ši riba buvo maždaug 60 procentų skiepytų gyventojų, tai delta, pasak mokslininko, ji gali būti didesnė - apie 80–85 proc.

„Tai vienintelis kartas, kai epidemiologiniai ir evoliuciniai sumetimai skiriasi“, - sako Kondrašovas. - Epidemiologiniu požiūriu, kai skiepijame visus gudriai, tai tampa vis geriau, geriau. Evoliucijos požiūriu, kai skiepijame visus gudriai, tai jau pavojinga “.

Ir jei norime sustabdyti pandemiją, mano mokslininkas, turime apie tai galvoti evoliuciniame kontekste - ir stengtis užkirsti kelią visam viruso vystymuisi. Tai galima padaryti tik sulėtinus jo plitimą, o tai reiškia, kad reikės ne tik skiepų, bet ir kaukių, patikrinimų pasienyje ir karantinų. Ir tada, ko gero, nereikės spėlioti apie naujojo varianto likimą pagal jo genomo nukleotidų modelį.

Rekomenduojamas: